Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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