Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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