Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC173Q0VFZ6 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms