Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX4Q06945 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.7 ms