Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPN11Q06124 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms