Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALD1Q05682 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms