Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms