Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SH3BGRP55822 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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