Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB27AP51159 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms