Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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