Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms