Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRG3Q9Y2Y8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms