Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCN11AQ9UI33 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN11AQ9UI33 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms