Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SEMA4CQ9C0C4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms