Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLVAPQ9BX97 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms