Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
APOBEC4Q8WW27 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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