Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms