Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms