Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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GABRA6Q16445 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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