Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CUL3Q13618 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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