Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FOXF2Q12947 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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