Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA3Q08378 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA3Q08378 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms