Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPIBQ01892 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms