Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DEFA5Q01523 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms