Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA3P32297 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA3P32297 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms