Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PTPRDP23468 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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