Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LMNB1P20700 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms