Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms