Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GLI3P10071 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GLI3P10071 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GLI3P10071 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GLI3P10071 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms