Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMCP01189 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POMCP01189 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POMCP01189 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POMCP01189 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POMCP01189 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms