Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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