Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCND1Q9NSA2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms