Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLVAPQ9BX97 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms