Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms