Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRIQ1Q96JM4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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