Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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