Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
NRF1Q16656 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NRF1Q16656 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms