Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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