Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CDSNQ15517 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CDSNQ15517 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CDSNQ15517 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CDSNQ15517 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CDSNQ15517 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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