Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms