Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PMS2P11Q13670 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms