Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FOXD4Q12950 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms