Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE4DQ08499 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms