Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP2C1P98194 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms