Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN10P78369 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms