Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TGFBR1P36897 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms