Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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