Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms