Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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KRTAP1-5Q9BYS1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
KRTAP1-5Q9BYS1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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