Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
IFT27Q9BW83 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms